閩南師範大學是本科批次的大學。自2020年，福建本科一批、二批合併為本科批次，取消了本科一批和本科二批的分別。如果閩南師範大學在考試所在的省份是本科二批招生的話，也可以説閩南師範大學是二本大學。
重點學科
省級重點實驗室：粒計算及其應用重點實驗室、現代分離分析科學與技術重點實驗室、認知與人格重點實驗室
省部級人文社科基地：海峽兩岸閩南文化研習交流基地、閩台區域文化與文學研究中心
福建省社會科學研究基地：閩南文化研究中心
省級2011協同創新計劃項目：區域農村教師發展協同創新中心
科研創新平台：現代分離分析科學與技術重點實驗室、 粒計算重點實驗室、菌物產業工程技術中心、文化詩學研究所、應用心理學研究所、閩南文化研究院
截至2018年10月，學校擁有國家級特色專業1個、國家級專業綜合改革試點項目1項、國家級創新教師培養模式示範項目1項、國家級校外實踐教育基地1個;省級專業綜合改革試點項目8項，省級特色專業5個;主持省級重大教育教學改革項目2項。省級教學團隊5個，省級人才培養模式改革創新實驗區7個，省級應用型專業羣試點項目5個(其中示範性應用型專業羣2個)，省級服務產業特色專業9個，省級精品課程、在線課程共27門，省級實驗教學示範中心16個。
