往來港澳通行證有效期5年。2014年9月15日，全面啟用電子往來港澳通行證規定，成年人電子往來港澳通行證有效期延長為10年，對未滿16週歲的仍簽發5年有效通行證。現用的本式往來港澳通行證將於2019年9月13日全部失效。
內地居民往來港澳簽註分為6個種類，即個人旅遊(G)、探親(T)、商務(S)、團隊旅遊(L)、其他(Q)、逗留(D)根據申請事由分類簽發。簽註規定每次在香港或者澳門逗留不超過7天，一進一出算一次。
以1年1次為例，不是表示1年內只能去1次，而是指該簽註的有效期為1年，在1年以內往返過港澳後，還可以再次申請簽註，申請次數沒有限制。如果1年內不去，則該簽註過期無效，可再次申請。
