在中國，有珠海普陀寺、上海海灣普陀寺、寶雞隴縣普陀寺等多個普陀寺。而人們一般所説的普陀寺是指位於福建鷺島五老峯前的南普陀寺。
南普陀寺始建於唐末五代，最初名叫泗洲院。在歷史的戰火與各種自然災害中，普陀寺於元朝被毀。明清時期，該寺院被重建後又被廢於兵禍。清康熙年間，施琅收復台灣後駐鎮廈門，捐資修復寺院舊觀，又增建大悲閣奉觀音菩薩，並以之與浙江普陀山觀音道場相類比，更名為南普陀寺。此後數百年來，經歷代主持的多次重修與擴建，至民國初年，已構成三殿七堂俱全的禪寺格局，成為近代閩南最具規模的名剎。
如今的南普陀寺香火旺盛，已經成為了來廈門旅遊必去景點之一。
