1、地理位置不同：太倉站位於江蘇省太倉市蘇州東路，地跨新塘和陸渡，大部分在新塘張橋村境內。而太倉南站地處太倉市新城區南星路。2、功能不同：太倉站服務滬通鐵路、蘇南沿江鐵路兩條鐵路線，在地理位置上居太倉市中心。而太倉南站僅服務於滬通鐵路，離主城區5公里左右。3、車次不同：太倉站一共有80班車次，而太倉南站僅有13班車次。
太倉站和太倉南站區別
太倉站——位於中國江蘇省蘇州市太倉市，是中國鐵路上海局集團有限公司管轄的鐵路車站，是滬蘇通鐵路、江蘇南沿江城際鐵路的交匯車站。
2020年5月27日，太倉站站房主體工程完工；7月1日，太倉站隨滬蘇通鐵路的通車投入使用。截至2020年7月，太倉站站房建築面積10998平方米，站場規模2台6線。
太倉南站——位於中國江蘇省蘇州市太倉市，是中國鐵路上海局集團有限公司管轄的鐵路車站，是滬蘇通鐵路的中間站。
2019年7月12日，太倉南站配套工程開工建設；2020年7月1日，太倉南站正式投入使用。截至2020年7月，太倉南站站房面積5999平方米，站場規模為2台5線。
