測量部位不同：耳温槍由於結構特點，更適用於測量耳道。而額温槍就可以用於測量額頭、頸部以及手腕等身體表面任何部位。體温準確度不同：耳温槍與額温槍相比較，耳温槍的結果會更真實準確。由於鼓膜位於外耳道的最深處，不易受到外界温度的影響，更能比較準確的反映體內的真實體温。
額温槍和耳温槍相比，耳温槍會更好。因為額頭的温度，容易受周圍環境以及風速影響，比方風大，額頭表面皮膚的温度會降低。如果吹空調，在低温空調的環境裏，可能體温也會降低。但是耳温是比較恆定的，因為耳道相對是比較密閉的空間。温度是相對恆定的，所以醫院裏一般常用的温度計都是耳温計，或者是腋下的温度計。
當然，有些篩查的項目，可能會用額温槍，因為操作比較快，所以常規用於篩查項目，比方幼兒園的入園晨檢，或者是在大型場所的體温監測，都是用額温槍。
額温槍的温度比腋温要偏低0.5-1℃，如果額温槍測量將近37℃左右的時候，需要用腋温計或者是耳温計，進行進一步測量，看看有沒有體温升高的情況。
