巴氏消毒法目前一直是國際上很通用的一種殺菌滅毒的辦法，優點是可以不破壞有益菌的存在，但是缺點就是殺菌的時間是有限制的，儘管如此，巴氏消毒法的使用仍舊是非常的廣泛且重要。那麼巴氏消毒法的基本原理是什麼呢？
1、巴氏消毒法是將混合的原料加熱，直到温度達到68～70℃的時候，保持這個温度30分鐘的時間，然後對物品進行急速的冷卻，到4-5℃。經此法處理後，可殺滅致病性細菌，混合原料經過加熱之後如果突然的冷卻，那麼這種極具的温度變化也會促使細菌死亡。一定温度範圍內，如果温度越低，那麼細菌的繁殖速度就越慢；如果温度越高，那麼它繁殖的速度就越快。但是如果温度太高，細菌就會逐漸的開始死亡。
2、巴氏消毒法就是利用了病原體不耐熱的特點，用温度和時間處理，將其全部殺滅。巴氏消毒法的種類繁多。低温長時間處理只被小型乳品廠用來生產一些奶酪製品。高温短時間如今被廣泛應用於牛奶生產。將牛奶加熱到62-65℃，保持30分鐘，可殺死各種生長型致病菌。
3、還有一種方法是將牛奶加熱到75~90℃，保温15-16s，殺菌的時間更短，工作效率更高。不過巴氏消毒法殺菌的基本原則是，只要能將病原菌殺死即可，如果説温度太高或者是殺菌的時間過長反而就會有較多的營養產生了損失。
以上是針對於巴氏消毒法基本原理的一些介紹，巴氏消毒法目前的應用最多的就是飲品中，在食物中的應用並不常見。巴氏消毒法中熱處理的程度所需要的温度比較低，一般都是在低於水的沸點温度下進行持續的加熱。
