1、地址不同：峨眉山站是成綿樂高鐵站，位於峨眉山景區門口，峨眉站則是成昆鐵路的火車站，在峨眉山市區。2、服務不同：峨眉山站是為了服務前往景區的乘客，峨眉站是一個高鐵和普通列車合二為一的站點，只要是去到峨眉山市區，即可乘坐這趟車。3、投用時間不同：峨眉山站是2014年12月20日開始投用的，而峨眉站投用時間為2017年4月26日，比峨眉要晚一些。
峨眉山站是中國鐵路成都局集團有限公司管轄的鐵路車站，也是成綿樂城際鐵路的終點站。峨眉山站的站房採用多重層疊屋頂，充分吸取景區建築的特質，與峨眉山勢相呼應。
峨眉山站的屋檐的靈動起翹是峨眉飄逸的語言，厚重的基座是其厚重的外形，精緻的木構杆件是其俊秀的內涵，並用不同層次的進深關係來表現峨眉的“神祕”。
峨眉站是中國鐵路成都局集團有限公司管轄的三等客貨站，也是成昆鐵路、峨攀鐵路和峨眉山鐵路的交匯站點。其站房為一座抽象“山”形建築，以“山，秀甲天下；佛，心繫眾生”為題眼，將峨眉山造型進行提煉、抽象、昇華，以曲線動態之勢，表達出對於柔美、起伏的峨眉山水的崇高敬意。
