顯微鏡是由主機架、物鏡、目鏡、鏡筒、載物台五大部分組成。顯微鏡以顯微原理進行分類可分為偏光顯微鏡、光學顯微鏡與電子顯微鏡和數碼顯微鏡。偏光顯微鏡是用於研究所謂透明與不透明各向異性材料的一種顯微鏡，在地質學等理工科專業中有重要應用。通常皆由光學部分、照明部分和機械部分組成。
主機架用於支持整台顯微鏡及維持平穩，是整個顯微鏡的主體。物鏡是決定顯微鏡的分辨率和成像清晰程度的主要部件。目鏡是用來觀察前方光學系統所成圖像的目視光學器件。鏡筒是安裝在鏡臂上方的圓筒狀結構，上連目鏡，下連物鏡轉換器。載物台是鏡筒下方的平台，中央有一圓形的通光孔，用於放置載玻片。顯微鏡是人類最偉大的發明物之一，它把一個全新的世界展現在人類的面前。
通常皆由光學部分、照明部分和機械部分組成。無疑光學部分是最為關鍵的，它由目鏡和物鏡組成。早於1590年，荷蘭和意大利的眼鏡製造者已經造出類似顯微鏡的放大儀器。光學顯微鏡的種類很多，主要有明視野顯微鏡（普通光學顯微鏡）、暗視野顯微鏡、熒光顯微鏡、相差顯微鏡、激光掃描共聚焦顯微鏡、偏光顯微鏡、微分干涉差顯微鏡、倒置顯微鏡。
顯微鏡目鏡長度與放大倍數呈負相關，物鏡長度與放大倍數呈正相關。即目鏡長度越長，放大倍數越低；物鏡長度越長，放大倍數越高。
