普通皖魚與黑皖魚的區別是：1、皖魚是指草魚，黑皖魚指青魚；2、體型不同：皖魚亞圓筒形，體長大1m餘，黑皖魚體亞圓筒形，青黑色，鰭灰黑色；3、習性不同：皖魚喜食幼蟲、藻類、蚯蚓、蜻蜓等，黑皖魚喜食螺螄肉、蜆、蚌、蝦、蜻蜓、幼蟲、水蟲等。
關於皖魚
皖魚是鯉科、草魚屬魚類。草魚的俗稱有：鯇、油鯇、草鯇、鯇魚、白鯇、草根(東北)等。體長為體高的3.4～4.0倍，為頭長的3.6～4.3倍，為尾柄長的7.3～9.5倍，為尾柄高的6.8～8.8倍。
體長形，吻略鈍，下嚥齒2行，呈梳形。背鰭無硬刺，外緣平直，位於腹鰭的上方，起點至尾鰭基的距離較至吻端為近。鰓耙短小，數少。體呈茶黃色，腹部灰白色，體側鱗片邊緣灰黑色，胸鰭、腹鰭灰黃色，其它鰭淺色。
關於黑皖魚
黑皖魚是鯉科、青魚屬魚類。體長可達145釐米。體長為體高的3.3～4.1倍，為頭長的3.5～4.4倍，體粗壯，近圓筒形，腹部圓，無腹稜。背鰭位於腹鰭的上方，無硬刺，外緣平直。體呈青灰色，背部較深，腹部灰白色，鰭均呈黑色。個體大，最大可達70餘千克。
