1、生產原料不同
巧克力的原料是可可豆，經過烘焙、壓碎、調配與研磨、精煉、去酸、回火鑄型等步驟製成。而咖啡的原料是咖啡豆，是用咖啡豆經過焙考研磨而製成的。
2、作用不同
巧克力的主要作用是為人體補充能量、蛋白質。具有很高的營養價值。咖啡雖然也有提高人體神經系統的功能。但更多的是讓人興奮，甚至很有可能讓人上癮。
3、營養價值不同
巧克力中含有豐富的蛋白質、糖類以及一些我們必須的微量元素，食用巧克力能有效的為我們補充這些元素，對我們人途健康有好處。
咖啡含有的成分更多的是咖啡因，攝入過多會刺激中樞神經系統、心臟和呼吸系統，另外，僅含有很少量的蛋白質，基本攝入不到我們體內。
咖啡豆和巧克力不是同一種物品。
咖啡豆是指用於製作咖啡的植物果實，廣義的講世界上有2種咖啡豆，阿拉比卡豆和羅伯斯塔豆，咖啡的果實是由兩顆橢圓形的種子相對組成的，互相銜接的一面為平坦的接面，稱為平豆，由一顆圓形種子組成的，稱為圓豆。
巧克力主要成分是可可脂，可可脂中含有可可鹼，對多種動物有毒，但對人類來説，可可鹼是一種健康的反鎮靜成分，故食用巧克力有提升精神，增強興奮等功效。
