轉基因食品破壞生態環境，時間一長會引起某些動物絕種；人類食用過多的轉基因食物的時候，就會出現噁心、嘔吐，精神不振等症狀；基因的種子和食品可能含有未知毒素和在人體內從未發現過的過敏原；很多轉基因食物都是國外研製引進國內的，因此，大面積推廣或者食用會嚴重威脅我國的食品安全。
轉基因食品指的就是利用轉基因生物技術獲得的轉基因生物品系，並以該轉基因生物為直接食品或為原料加工生產的食品稱為轉基因食品。轉基因食品有較多的優點，可增加作物產量、降低生產成本，增強作物抗蟲害和抗病毒等的能力，提高農產品耐貯性，縮短作物開發的時間，擺脱四季供應，打破物種界限，不斷培植新物種、生產出有利於人類健康的食品。
轉基因食品有很多，已批准安全證書的有棉花、水稻、玉米和番木瓜，只有棉花、番木瓜批准商業化種植。截至目前，我國批准了轉基因生產應用安全證書並在有效期內的作物有棉花、水稻、玉米和番木瓜。
目前，大米、大豆、胡蘿蔔、土豆、玉米、西紅柿、木瓜都有轉基因農產品。其中玉米使用轉基因最早、最廣、最多，還有就是夏威夷木瓜，絕大部分是轉基因產物。而還有不少"隱性"轉基因食品，其實使用了轉基因農產品製成的食品也是轉基因產品。
