大小區別：細菌菌落一般較小，甚至是比較不起眼的；而真菌菌落明顯會比細菌菌落大。顏色區別：細菌菌落的顏色一般都比較淡和淺，多為白色、透明色、黃色；真菌菌落顏多且較深，常見的顏色有綠、黑、褐、黃、綠色等。形態區別：細菌菌落表面光滑或粗糙，而真菌菌落的形狀各式各樣。
細菌菌落和真菌菌落的區別是什麼
細菌菌落是肉眼可見的菌塊，每一種細菌在一定條件下形成固定的菌落特徵，不同種或同種在不同的培養條件下，其菌落特徵是不同的。同樣的，真菌菌落也是肉眼可見的真菌菌落，和細菌菌落有着明顯的區別，如下;
1、大小方面
細菌菌落一般較小，甚至是比較不起眼的;但真菌菌落，特別是黴菌落落是比較大的，非常的顯眼的大小的對比。兩種菌落可以肉眼分辨誰是細菌菌落和真菌菌落。
2、顏色方面
細菌菌落一般是白色、透明色、黃色等，且基本上是比較淡和淺的顏色。真菌菌落的顏色是多種多樣的，常見的有綠、黑、褐、黃、綠色。例如：黴菌菌落最常見顏色是綠色和黑色。
3、形態方面
細菌菌落的表面要麼是光滑黏稠，要麼是粗燥乾燥的，十分有特色，很容易分辨。真菌菌落的形狀各式各樣，有蜘蛛網狀的，有絮狀的，還有絨毛樣子的。
