冷藏保存法：首先要將蒜苗充分預冷，預冷的主要目的是降低蒜苗的呼吸強度，以便於存儲和運輸。將蒜苗充分預冷後，放入冰箱存儲，裝入筐或板條箱內，或直接堆垛在貯藏的貨架上，使庫温控制在1℃左右。這樣蒜苗就可以保存的時間比較久，而且還可以是蒜苗保持鮮度。
降氧法：降氧法又可以分為兩種：快速降氧法和自然降氧法，前提都是密封保存。快速降氧法法指的是密封之後連續抽氧灌氮3到4次，自然降氧法指的是蒜苗密封之後，袋中的氧氣由蒜苗自行吸收。在這裏需要的是，保存環境的含氧量要控制在3%，二氧化碳在10%左右為好。
充二氧化碳法：使用這種方法時，蒜苗密封好之後，先吸出袋中的少量氣體，然後充入二氧化碳，讓氧氣和二氧化碳含量基本相同即可。
堆垛法：將蒜苗放涼後裝進條板箱裏，或者直接堆在貨架上，其温度最好設定在1℃左右。保存蒜苗新鮮最重要的就是温度。
真空保存法：將蒜苗放進密封袋中，抽部分空氣之後密封保存。保存蒜苗的袋內氧含量宜在1-3%，二氧化碳含量在10%，温度應為14-16℃。
